sábado, 15 de junio de 2024

Una técnica de PCR

 Técnica de PCR en la influenza (virus de la gripe)


Los virus de la influenza son virus de ARN, existen tres tipos (tipo A, B y C). El genoma viral segmentado está encerrado en una envoltura superficial que contiene lípidos y que tiene hemaglutinina (H) y neuraminidasa (N), dos antígenos de superficie principales. La confirmación de la influenza (virus de la gripe) se puede realizar mediante cultivo del virus, RT-PCR o anticuerpos neutralizantes específicos en la sangre a partir de hisopos nasofaríngeos/faríngeos o aspirados traqueales en pacientes intubados, preferiblemente dentro de los 4 a 5 días posteriores a la enfermedad. La prueba de reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real (RT-PCR) sigue siendo la principal base de diagnóstico (1).


Imagen. Researchgate.net [Internet] [citado 15 junio 2024]. Disponible en: https://www.researchgate.net/figure/Figura-1-Flujograma-que-resume-los-pasos-de-la-tecnica-RT-PCR-1-Recoleccion-de-las_fig1_357357615

Tema: Diagnostico del virus de la gripe (Influenza)

Objetivo: Presentar la técnica de reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real (RT-PCR) múltiple para la detección del virus de la gripe (influenza), lo que la convierte en un método indispensable en diversos campos de la biología molecular y la medicina

Tipo de muestra biológica: hisopado nasofaríngeo/orofaríngeo o aspirados

Tipo de ácido nucleico: ARN viral, su extracción se realizó usando el kit comercial QIAamp® Viral RNA mini kit (Qiagen) y se almacenó a -80 ºC hasta el procedimiento de RT-PCR múltiple

Gen o secuencia a amplificar: gen de la matriz del virus influenza A (1027 pb), gen de la nucleoproteína del virus influenza B (1565 pb) y el gen GAPDH de las células huésped (1200 a 1500 pb), gen de la hemaglutinina de los subtipos A (H1N1) pandémico (pdm09) con 13,600 pb y A (H3N2) con 13,588 pb

Tipo de PCR: RT-PCR múltiple en tiempo real.

Número de copias: El límite de detección viral fue del rango de 7 a 9 copias/µL por virus

Visualización: Para visualizar los resultados de una RT-PCR múltiple se utilizan: electroforesis en gel, microarrays y fluoróforos específicos (2).

Bibliografía

1.- Kumar V. Influencia en niños. Indian J Pediatr [Internet]. 2016 [citado 15 Jun 2024]; 84(2):139-143. Disponible en: https://link.springer.com/article/10.1007/s12098-016-2232-x

2.- Marcos P, Huaringa M et al. Detección de virus influenza A, B y subtipos A (H1N1) pdm09, A (H3N2) por múltiple RT-PCR en muestras clínicas. Rev. Perú. Med. [Internet]. 2017 [citado 17 de junio 2024]; vol.34 no.2. Disponible en: http://www.scielo.org.pe/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1726-46342017000200005



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